Obecny kształt spółka CKTiS przybrała w wyniku transformacji i zmian jakie miały miejsce na przestrzeni wielu lat. W 1991r. powstała w drodze utworzenia przez CPN, spółki z ograniczoną odpowiedzialnością CPN Marine Service z siedzibą w Gdańsku. W 1992 roku, CPN Marine Service uruchomił skład celny paliw oraz rozpoczął działalność związaną z przechowywaniem paliw płynnych współpracujac z firmami krajowymi i zagranicznymi. Na przestrzeni lat głównym udziałowcem firmy był PKN ORLEN. Ważnym osiągnięciem przedsiębiorstwa w tym okresie było uczestniczenie w tworzeniu Polskiej Platwormy Biopaliw i Biokomponentów. W roku 2004 doszło do zmiany nazwy i rozszerzenia przedmiotu działalności przedsiębiorstwa. Od tego czasu firma nosiła nazwę Centrum Komercjalizacji Technologii w skrócie CKT Sp. z o.o., a rok później została aportem wniesiona do Płockiego Parku Przemysłowo Technologicznego S.A.. W tym okresie CKT Sp. z o.o. swoją działalność opierała o współprace z Płockim Parkiem Przemysłowo Technologicznym S.A., zapewniając mu wsparcie w szeroko rozumianym obszarze biznesowym. W roku 2009 firma w wyniku zmian własnościowych zostaje ostatecznie przeformowana i przyjmuje nazwę CKTiS Sp. z o.o.